Сборник от електронната юбилейна научна конференция с международно участтие “Животновъдната наука-предизвикателства и иновации, 5 ноевмври, 2020 г., Костинброд
Печат Авангард Прима, София, ISBN 978-619- 90918-5-2, eISBN 978-619- 90918-5-2, ИЖН - Костинброд
Печат Авангард Прима, София, ISBN 978-619- 90918-5-2, eISBN 978-619- 90918-5-2, ИЖН - Костинброд
Proceedings of the online anniversary scientific conference with international participation “Animal Science- Challenges and Innovations”, 5 November, 2020, Kostinbrod
Printed by Avangard Prima, Sofia, ISBN 978-619- 90918-5-2, eISBN 978-619- 90918-5-2, IAS- Kostinbrod
Printed by Avangard Prima, Sofia, ISBN 978-619- 90918-5-2, eISBN 978-619- 90918-5-2, IAS- Kostinbrod
ИЗПОЛЗВАНЕ НА МОЛЕКУЛЯРНИ МАРКЕРИ ЗА ОЦЕНКА НА ГЕНЕТИЧНОТО РАЗНООБРАЗИЕ ПРИ МЕСТНОТО СИВО ГОВЕДО
USE OF MOLECULAR MARKERS TO ASSESS GENETIC DIVERSITY IN LOCAL GRAY BOVINE
USE OF MOLECULAR MARKERS TO ASSESS GENETIC DIVERSITY IN LOCAL GRAY BOVINE
Автори / Authors
Денис Вирянски, Атанаска Тенева
Denis Viryanski, Atanaska Teneva
Резюме / Abstract
Генетичното разнообразие, основано на ДНК маркери - микросателити при породата Сиво говедо, отглеждано в България е малко проучено. Основната цел на настоящето изследване е характеризиране на генетичните ресурси и биоразнообразие при популация животни от породата Сиво говедо, отглеждани в България чрез използване на молекулно-генетични ДНК маркери. В проучването е включен панел от 11 микросателитни маркера (STR) препоръчани от ISAG/FAO за генотипиране и оценка на генетичното разнообразие при говеда. Изследвани са 179 животни от популация на Сиво говедо, отглеждано в Тополовградския регион. Всички от изследваните локуси бяха информативни и полиморфни. Общо са открити 96 алела със средна стойност 8,72 в 11-те микросателитни локуса, от които 26 (36.9%) бяха с честота >0.5. Микросателитните маркери, използвани в това проучване, показват стойности на PIC от 0,72 (BM1824) до 0,89 (TGLA 227) със средно 0,79. Наблюдаваната хетерозиготност (Ho) варира от 0.851 (локус ETH10) до 0.969 (TGLA 227). Очакваната хетерозиготност (генно разнообразие - He) варира от 0,392 в локус BM1824 до 0,806 в локус ETH225. За всички 11 локуса средната хетерозиготност е съответно Ho = 0,935 и He = 0,649. Ефективният брой алели (N) е между 7 (TGLA122, INRA23, BM2113) и 17 (TGLA53). Изчислените стойности на параметрите на генетичното разнообразие – PIC, Ho, He и MNA показаха, че всички микросателитни маркери са полиморфни. Всички изследвани локуси се характеризират с високо (>0,5) полиморфно съдържание (PIC) и се наблюдава хетерозиготност (Ho>0,6).
The genetic diversity based on DNA markers – microsatellites in the Gray Cattle breed reared in Bulgaria is little known. The main goal of the study was genetic characterization of AnGR and estimation of genetic diversity of a population from Grey cattle on the base of molecular markers. In the present study 11 microsatellite markers (STR) recommended by ISAG/FAO in cattle were used for genotyping and assessment of genetic diversity in 179 animals from the population of Gray cattle inhabiting the region of Topolovgrad. All of the studied loci were informative and polymorphic. A total of 96 alleles with a mean value of 8.72 were detected in the 11 microsatellite loci, of which 26 (36.9%) had a frequency >0.5. The microsatellite markers used in this study showed PIC values ranging from 0.72 (BM1824) to 0.89 (TGLA227) with an average of 0.79. The observed heterozygosity (Ho) ranged from 0.851 (ETH10 locus) to 0.969 (TGLA227). The expected heterozygosity (genetic diversity – He) varies from 0.392 at locus BM1824 to 0.806 at locus ETH225. For all 11 loci, the mean heterozygosity is Ho = 0.935 and He = 0.649, respectively. The effective number of alleles (N) is between 7 (TGLA122, INRA23, BM2113) and 17 (TGLA53). The calculated values of PIC, Ho, He and MNA showed that all microsatellite markers are polymorphic. All examined loci were characterized by a high (>0.5) polymorphic content (PIC) and heterozygosity (Ho>0.6) was observed.
Ключови думи / Keywords
микросателити, молекулярни маркери, полиморфизъм, SSR, Сиво говедо
Microsatellites, Molecular markers, Polymorphism, SSR, Gray cattle
Viryanski, D., & Teneva, A. (2020). Use of Molecular Markers to Assess Genetic Diversity in Local Gray Bovine. Proceedings of the online anniversary scientific conference „Animal Science – Challenges and Innovations”, 5 November, 2020, Kostinbrod, Institute of Animal Science – Kostinbrod, Sofia, Bulgaria, ISBN 978-619- 90918-5-2, eISBN 978-619- 90918-5-2, pp. 287–298.
DOWNLOAD THE FULL TEXT AS PDF FILE HERE